MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015665	ACGTT	2	10	31	40	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015665	A	6	6	55	60	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015665	AGAA	2	8	99	106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015665	A	6	6	105	110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015665	GGC	2	6	111	116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015665	TCAAG	2	10	245	254	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015665	AT	3	6	838	843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015665	AAGT	2	8	861	868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015665	ATT	2	6	901	906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015665	ACC	2	6	929	934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015665	TGA	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015665	T	6	6	1040	1045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015665	TCA	2	6	1091	1096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015665	TCTT	2	8	1126	1133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015665	GAA	2	6	1177	1182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015665	ATA	2	6	1183	1188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015665	ACA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015665	CTG	2	6	1309	1314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015665	AAT	2	6	1320	1325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015665	TCT	2	6	1329	1334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015665	AGG	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015665	TGA	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015665	CTG	2	6	1621	1626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015665	T	6	6	1660	1665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015665	T	7	7	1733	1739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015665	T	8	8	1743	1750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015665	A	6	6	1808	1813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015665	TGC	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015665	AC	4	8	1875	1882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015665	ACACA	2	10	1885	1894	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015665	GAT	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015665	T	6	6	3448	3453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015665	CAC	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015665	TAC	2	6	3485	3490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015665	TAA	2	6	3521	3526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015665	CATA	2	8	3571	3578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015665	CTC	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015665	T	6	6	4398	4403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015665	TAG	2	6	4551	4556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015665	CTTC	2	8	4565	4572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015665	TGTAA	2	10	4597	4606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015665	GATA	2	8	4607	4614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015665	CA	3	6	4662	4667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015665	TG	3	6	4690	4695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015665	TTTA	2	8	4720	4727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015665	TGT	2	6	5935	5940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015665	T	6	6	5966	5971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015665	CAT	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015665	CTG	2	6	6016	6021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015665	CAG	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015665	T	6	6	6034	6039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015665	CCG	2	6	6066	6071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015665	T	9	9	6083	6091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015665	T	6	6	8351	8356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015665	GAAACA	2	12	8384	8395	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015665	A	7	7	8422	8428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015665	CGG	2	6	8440	8445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015665	T	6	6	8469	8474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015665	AATG	2	8	8502	8509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015665	CAT	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015665	A	6	6	8684	8689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015665	TGC	2	6	8706	8711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015665	CGAA	2	8	8753	8760	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015665	CTT	2	6	8894	8899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015665	TTATT	2	10	9122	9131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015665	T	6	6	9147	9152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015665	T	6	6	9157	9162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015665	TTGT	2	8	9232	9239	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015665	GCA	2	6	9273	9278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015665	TCAAG	2	10	9286	9295	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015665	ATT	2	6	9300	9305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015665	CCG	2	6	9339	9344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015665	TCT	2	6	10964	10969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015665	AAAAT	2	10	10992	11001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015665	TAA	2	6	11047	11052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015665	T	6	6	11098	11103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015665	TAAA	2	8	11113	11120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015665	A	6	6	11418	11423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015665	GGA	2	6	11441	11446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015665	TCC	2	6	11455	11460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015665	T	6	6	11461	11466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015665	T	6	6	11498	11503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015665	A	6	6	11528	11533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015665	TAA	2	6	11540	11545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015665	GAA	2	6	11599	11604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015665	GTC	2	6	11611	11616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015665	TTCA	2	8	11632	11639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015665	ACG	2	6	11930	11935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015665	AAAAG	2	10	11971	11980	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015665	GCG	2	6	12021	12026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015665	CCTG	2	8	12052	12059	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015665	CTG	2	6	12062	12067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015665	AAGC	2	8	12137	12144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015665	CAT	2	6	12164	12169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015665	GTG	2	6	12217	12222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015665	C	6	6	12265	12270	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_015665	TTGC	2	8	12274	12281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015665	AGC	2	6	12357	12362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015665	CGC	2	6	12404	12409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015665	AAC	2	6	12463	12468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015665	A	7	7	12514	12520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015665	AAG	2	6	12531	12536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015665	T	6	6	12551	12556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015665	CGG	2	6	12563	12568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015665	AAT	2	6	12621	12626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015665	TCA	2	6	12648	12653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015665	CATG	2	8	12657	12664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015665	CCA	2	6	12697	12702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015665	GTT	2	6	12710	12715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015665	GGT	2	6	12741	12746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015665	T	6	6	12750	12755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015665	ACA	2	6	12786	12791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015665	TAAA	2	8	12818	12825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015665	GGA	2	6	12833	12838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015665	GAAA	2	8	12989	12996	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015665	GTT	2	6	13007	13012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015665	T	7	7	13020	13026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015665	ATC	2	6	13040	13045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015665	ATT	2	6	13049	13054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015665	TTAG	2	8	13092	13099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015665	GTG	2	6	13117	13122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015665	T	6	6	14077	14082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015665	CAC	2	6	14105	14110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015665	AAT	3	9	14120	14128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015665	TAA	2	6	14131	14136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015665	TACG	2	8	14139	14146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015665	TCT	2	6	14168	14173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015665	AGC	2	6	14207	14212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015665	GAT	2	6	14255	14260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015665	ATC	2	6	14288	14293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015665	ATT	2	6	14319	14324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015665	ATT	2	6	14510	14515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015665	T	6	6	14514	14519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015665	CTT	2	6	14574	14579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015665	T	7	7	14587	14593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015665	AATT	2	8	14651	14658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015665	T	7	7	14690	14696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015665	CTG	2	6	14706	14711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015665	AAT	2	6	14744	14749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015665	ACA	2	6	14843	14848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015665	CCA	2	6	14864	14869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015665	CTTTCT	2	12	14884	14895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015665	TTC	2	6	14917	14922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015665	A	6	6	14955	14960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015665	GC	3	6	15005	15010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015665	T	7	7	15025	15031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015665	CGG	2	6	15056	15061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015665	CT	3	6	15067	15072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015665	CTT	2	6	15079	15084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015665	A	6	6	15115	15120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015665	GA	3	6	15187	15192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015665	CGT	2	6	15214	15219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_015665	TTC	2	6	15256	15261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_015665	T	6	6	15290	15295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015665	AAT	2	6	15368	15373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015665	ACA	2	6	15403	15408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_015665	ATG	2	6	15433	15438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015665	GCG	2	6	15473	15478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_015665	CCG	2	6	15591	15596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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162	NC_015665	AGGT	2	8	15691	15698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015665	CTT	2	6	16856	16861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015665	GTT	2	6	16897	16902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015665	CTTT	2	8	16947	16954	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_015665	GC	3	6	17010	17015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_015665	GCC	2	6	17213	17218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_015665	ACT	2	6	17248	17253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_015665	TATT	2	8	17259	17266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015665	A	7	7	17304	17310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015665	A	6	6	17379	17384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015665	T	7	7	17393	17399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015665	TCG	2	6	18564	18569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_015665	A	7	7	18609	18615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015665	A	6	6	18681	18686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015665	TGA	2	6	18804	18809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_015665	T	7	7	18964	18970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_015665	TCC	2	6	19954	19959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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184	NC_015665	TAAA	2	8	21610	21617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015665	TTAAA	2	10	21631	21640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015665	TC	3	6	23160	23165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
187	NC_015665	ACC	2	6	26959	26964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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189	NC_015665	T	8	8	27582	27589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015665	A	7	7	27611	27617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_015665	T	6	6	27655	27660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_015665	AAT	2	6	29921	29926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_015665	T	7	7	33029	33035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_015665	GTT	2	6	34315	34320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_015665	AAT	2	6	34355	34360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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336	NC_015665	AGA	2	6	45170	45175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_015665	AAT	2	6	65462	65467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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